简化外显子组测序：cSNP-Seq
基于大量重测序及全外显子组重测序数据，从IWGSC注释HC基因中选取包含变异信息最丰富的区域进行捕获探针设计，确保每个HC基因至少有一个代表区段被覆盖。包含11万HC基因编码区内的600K cSNP。
cSNP-Seq vs SNP芯片
| cSNP-Seq | 芯片 |
检测方法 | 捕获测序 | 芯片检测 |
标记数量 | >600K | 50K、55K、660K |
标记类型 | SNP/InDel/CNV | SNP |
标记序列 | 可获取 | 无法获取 |
检测新变异 | 是 | 否 |
样品准备
突变体群体、自然群体、组图群体材料
| 样品类型 | 数量要求 | 存放形式 |
样品要求 | 组织样品 | ≥2cm叶片 | 1.5mL 离心管 |
DNA样品 | ≥2μg DNA | 0.2mL EP管 |
BSA基因定位材料
质量性状群体，每个极端性状混池≥25个极端个体材料 |
数量性状群体，每个极端性状混池≥35个极端个体材料 |
| 样品类型 | 数量要求 | 存放形式 |
样品要求 | 组织样品 | ≥2cm叶片 | 1.5mL 离心管 |
DNA样品 | ≥2μg DNA | 0.2mL EP管 |
RNA样品 | ≥2μg 总RNA | 0.2mL EP管 |